Ao Conselho Fiscal compete examinar e emitir parecer sobre os balanços patrimoniais e demais demonstrações financeiras, bem como sobre as demonstrações financeiras e prestações de contas trimestrais da Diretoria da Agência, e exercer outras atribuições previstas na legislação vigente. O Conselho Fiscal é constituído por três membros efetivos e respectivos suplentes.
Atualmente o Conselho Fiscal é composto pelos seguintes membros: